Мэдаку Куроками (黒神めだか) — первый класс старшей школы — выбирают президентом школьного совета. Первая же вещь, которую она делает на новой должности — учреждает ящик для отзывов и предложений, позже прозванный учениками «Ящиком [[Мэдаки]]». Она призывает учеников без колебаний опускать в ящик письма с любыми их проблемами и обещает браться за любое дело от кого угодно.

Так как Мэдака выиграла выборы в школьный совет с ошеломляющими 98% голосов, получилось, что она — единственный член совета. Она просит своего друга детства Зэнкичи Хитоёши (人吉 善吉) о помощи, и тот неохотно, но соглашается вступить в совет. Вскоре Мэдака вербует ещё двоих учеников: бывшего члена клуба дзюдо Коки Акунэ (阿久根 高貴) в качестве секретаря и участницу плавательного клуба Могану Кикайджиму (喜界島もがな) за ежедневную плату в 300 йен в качестве казначея.

Теперь школьный совет проводит время, решая проблемы, переданные им через «Ящик Мэдаки», будь то хулиганы, торчащие в клубах, в которых они не состоят, девушки, которым требуется помощь в написании любовного письма, или люди, потерявшие своих домашних животных.

Medaka Kurokami is, in the truest sense of the word, perfect. Beautiful, intelligent, and athletic, Medaka's dream is to make others happy. So when she runs for Student Council President of the prestigious Hakoniwa Academy, winning the election with 98% of the votes is only to be expected.

The very first thing the boisterous new president does is set up the "Medaka Box," a suggestion box allowing students to submit any kind of request for assistance. Together with the cynical Zenkichi Hitoyoshi, her childhood friend who has been strong-armed into helping, Medaka fulfills these requests at a ridiculous rate. For every job completed, she adds flowers to the student council room, with the aim of filling the entire school. However, the two are about to find out that helping others may be a lot harder than they think as they begin to uncover a devastating plan centering on the academy and even Medaka herself!

[Written by MAL Rewrite]