Действие аниме происходит в 2011 году. Десептиконы во главе с Гальватроном наносят внезапный удар по родной планете с целью захвата Сигма-компьютера, который находится в нестабильном состоянии и нуждается в защите. В разгар масштабной битвы, когда ничто не предвещало спасения, к автоботам присоединились четыре бесстрашных воина-хэдмастера: Хромедом, Хардхед, Брейнсторм и Хайбрау во главе с Фортрессом Максимусом. Все они обладают новой формой трансформации. Вскоре они приняли решение вернуться в родную гавань, и так вышло, что в стане десептиконов уже сражаются их некогда заклятые враги. Смогут ли автоботы вместе с новыми союзниками преодолеть этот тяжелейший кризис на Кибертроне и вернуть на свою планету мир?

Headmasters starts with Galvatron leading a new batch of Destrons to wage war on Cybertron, the Destron Headmasters. The Cybertrons are rescued by the arrival of the Cybertron Headmasters, led by Fortress (Cerebros, the head of Fortress Maximus). It is revealed that Fortress Maximus left Cybertron millions of years ago in search of energy, and have finally managed to come home. He explains that the Headmasters are from a planet called Master; the human-sized robots who live there built themselves Transformers-sized bodies. They can then transform themselves into the heads of the robots, and have now joined the Cybertron-Destron war.

(Source: ANN)