1863 год эпохи Эдо. Япония уже долгое время страдает от политических разногласий, выливающихся в жестокие уличные столкновения и убийства. В Киото сформировывается новый отряд самураев для восстановления порядка и поддержки сил Айдзу — Росингуми. Однако прошлое членов отряда и подрыв авторитета уже разделили его на две противоборствующие стороны, возглавляемые жестким и самоуверенным Камо Сэридзавой [芹沢鴨] с одной стороны и великодушным и более мягким Исами Кондо — с другой.

По воле случая Рюносукэ Ибуки попадает в вихрь событий и жизни отряда, вынужденный остаться временно в услужении, расплачиваясь за своё спасение, несмотря на личную ненависть к самураям и всему, что с ними связано. Но глядя на то, как живёт половина во главе с Кондо, Ибуки постепенно начинает верить, что не всё ещё потеряно для Японии, как и для него самого, если только они смогут укрепить своё положение, возвыситься и развеять власть жестокого и безрассудного Сэридзавы.

Beaten and left to perish, Ryuunosuke Ibuki is robbed of everything to his name. Seeing him in such a pitiful state, a man named Kamo Serizawa gives him a second chance and offers him to become his personal assistant. Ibuki seems to be spared by grief, but this new lifestyle only makes him nothing more than a dog to one of the most influential men in all of Kyoto.

Meanwhile, with the rise of ronin attacks on the general population, the shogunate sends the Roshigumi to Kyoto to strike for peace. Led by the honorable yet soft-spoken Isami Kondou, the Roshigumi is composed of strong and skilled samurai but lacks any meaningful political connections to gain footing in the city plagued by crime. Having no other choice, Kondou allies with the arrogant Serizawa and his connections in exchange for their combative strength.

Despite hating everything the samurai stand for, Ibuki finds himself tangled in the business of the Roshigumi. However, as he interacts with the members under Kondou's leadership, Ibuki slowly realizes that not all samurai are as cruel and dishonorable as he once thought. Hakuouki Reimeiroku explores the early days leading up to the formation of the Shinsengumi while the political tension in Kyoto gives rise to instability and uncertainty.

[Written by MAL Rewrite]