Далёкое будущее. Земля и бо́льшая часть человечества порабощены воинственной империей [[Иллюмидус]]. Харлок [キャプテン・ハーロック] — капитан «Призрачной смерти», космического крейсера, перевозящего беженцев, один из немногих оставшихся противников тирании инопланетных захватчиков — тоже терпит поражение. Подвергшись атаке оккупационных сил Иллюмидуса, он вынужден совершить посадку на одной из захваченных врагами баз Земли.

На захваченной Иллюмидусом базе Харлок встречает Тотиро Ояму [大山トチロー], который показывает ему великолепный линкор, созданный им по потерянным технологиям своих предков, и называет его «Аркадия», в честь родины клана благородных пиратов-рыцарей Харлоков.

Космический капитан Харлок, последний потомок из клана пиратов-рыцарей, начинает свой путь, чтобы освободить Землю и всё человечество.

Earth has been conquered by the evil Illumidus Empire, with parallels drawn to the U.S. post World War II occupation of Japan. Captain Harlock with a group that will become his life long friends begin their fight against this tyranny visited upon the planet Earth, with no regard to the costs the struggle will have on them, caring only for the ideal of restoring freedom to the people of Earth.

(Source: ANN)