Прямое продолжение первого сезона. Зеро (錐生零) возвращается после его исчезновения из Академии. Несмотря на испытываемое ею облегчение, Юки (黒主優姫) (чьё прошлое по-прежнему покрыто тайной), гадает, что же именно случилось с Зеро после того, как они разлучились. Зеро, сохранив странные видения, появившееся в тот день, когда он испил крови Канаме (玖蘭枢), посещает пробудившуюся Марию Куренай (紅まり亜) в поисках ответов на свои вопросы. Она не даёт ему ничего, кроме загадочной подсказки, содержащей предположение о том, кто может быть настоящим врагом.

Тем временем вампиры из Высшего Совета Вампиров прибывают в академию с целью покарать Зеро за совершённый им грех — убийство чистокровного. Однако Канаме вмешивается в решение совета — не только с целью спасти Зеро, но и по иной причине, о которой не догадывается никто из его окружения.

When the missing Zero Kiryuu returns to Cross Academy, Yuuki Cross is relieved to see him safe, but finds that Zero has changed in more ways than one. As a result of choices he made, Zero is plagued by visions, and he seeks to uncover the reason behind them—unaware that the answers may be much closer than he thinks.

Soon Yuuki also begins to be tormented by ghastly hallucinations, and she seeks an explanation about her shrouded past from the only one who can provide clarity: Pureblood vampire Kaname Kuran, who is closest to her heart. But what will happen when the truth is finally revealed?

[Written by MAL Rewrite]