Действие происходит в далёком будущем после Третьей мировой войны, названной впоследствии Армагеддоном. Даже после Армагеддона война между вампирами и человечеством не утихла и продолжается до сих пор. Для того, чтобы защитить людей от вампиров, Ватикан вынужден полагаться на союзников, оказавшихся с ним по одну сторону баррикад.

Главный герой, священник по имени Авель Найтроуд, путешествует по странам в качестве представителя Ватикана. В то же время он является агентом АХ, особого подразделения, созданного кардиналом Катериной Сфорцей [カテリーナ・スフォルツァ]. И скорая встреча Авеля [アベル・ナイトロード] с молодой девушкой по имени Эстер [エステル・ブランシェ] предопределит исход борьбы между вампирами и человеческой расой.

Following Armageddon, an apocalyptic war, mankind faces yet another menace: vampires. The continuous confrontations between the races have split the world into separate factions. The race of vampires, Methuselah, are affiliated with the New Human Empire; whereas the humans, deemed Terrans by the vampires, make up the Vatican Papal State. Furthermore, extremist groups like the Rosenkreuz Order strive to rekindle a war, despite the factions' attempts to avoid direct conflict.

To combat terrorist organizations, the Vatican has implemented the AX unit. Led by Cardinal Caterina Sforza, the AX agents investigate vampire-related disturbances with hopes that the Terrans and the Methuselah will one day achieve peaceful coexistence. Amongst the AX unit is priest Abel Nightroad—a seemingly disoriented but gentle-hearted fellow who is a fierce vampire slayer on the battlefield. Joining the unit as his partner is agent Sister Esther Blanchett, a brave and gentle young nun troubled with a tragic past.

As the two grow closer, they begin to uncover signs of malicious schemes and dark forces working in the shadows. But the path they walk is riddled with misfortune that might just force them to confront the memories that plague their hearts.

[Written by MAL Rewrite]