Много лет прошло с момента разрушения «Антэйку». На данный момент CCG — единственная организация, занимающаяся вопросом по защите людей от гулей, — решает взять над противником верх при помощи имплантации своим агентам какухо, защитного и охотничьего органа гулей. Имплантация прошла успешно, и, в итоге, был создан отряд «Куинкс» из четырёх человек, менторство над которыми взял Хайсэ Сасаки.

Хотя Хайсэ — первый из куинксов, его происхождение окутано тайнами и загадками, в частности для него самого. Сасаки с уверенностью может сказать, кем он является сейчас, однако не может вспомнить остальные двадцать лет своей жизни и понять, что за странные голоса сопровождают его мысли. Дабы навести порядок в голове, Хайсэ сосредоточивается на актуальных задачах: подготовке своих бойцов, а также достижении своей личной цели — превзойти следователя Кишо Ариму [有馬 貴将].

Отряд «Куинкс» должен научиться контролировать силу гуля внутри самих себя для того, чтобы продемонстрировать свои силы CCG. Многие другие команды смотрят на куинксов с подозрением, но Хайсэ и его отряд готовы побороться за репутацию.

Пока члены «Куинкса» изо всех сил пытаются реализовать себя, гули из «Древа Аогири» становятся для людей проблемой номер один. Как и всегда, все попытки CCG по уничтожения гулей на корню пресекаются всё новой и новой организацией гулей — более сильной, более умной, более собранной, чем предыдущая. По мере того, как война между человеком и гулем набирает обороты, на поле боя начинают появляться знакомые из прошлых сражений лица.

Two years have passed since the CCG's raid on Anteiku. Although the atmosphere in Tokyo has changed drastically due to the increased influence of the CCG, ghouls continue to pose a problem as they have begun taking caution, especially the terrorist organization Aogiri Tree, who acknowledge the CCG's growing threat to their existence.

The creation of a special team, known as the Quinx Squad, may provide the CCG with the push they need to exterminate Tokyo's unwanted residents. As humans who have undergone surgery in order to make use of the special abilities of ghouls, they participate in operations to eradicate the dangerous creatures. The leader of this group, Haise Sasaki, is a half-ghoul, half-human who has been trained by famed special class investigator, Kishou Arima. However, there's more to this young man than meets the eye, as unknown memories claw at his mind, slowly reminding him of the person he used to be.

[Written by MAL Rewrite]