Уже знакомые нам по первому сезону героини Шерли [シャーロック・シェリンフォード], Ниро [譲崎ネロ], Элли [エルキュール・バートン] и Корделия [コーデリア・グラウカ] так и не восстановили свои способности после боя с королевой преступного мира. Но девочки даже не думают переживать по этому поводу! Их уже не пугает отчисление из Академии Холмса, проживание в пыльной каморке и жизнь впроголодь. Учёбу некогда великие детективы бросают, питаются тем, что сами и выращивают, а в свободное время побираются по улицам.

Сдаёт свои позиции и «Четвёрка гениев», бывшие конкурентами «Милки Холмс»: их лидер Кокоро Акэти [明智 小衣] попадает в руки мошенницы, и теперь «Четвёрке» грозят серьёзные неприятности.

Президент школьного совета Анриетта [アンリエット・ミステール] в отчаянии и решается на крайние меры. Вот только сможет ли она наставить девочек на путь истинный?..

Second season of Tantei Opera Milky Holmes.