Пятнадцатилетний Нэку Сакураба, увлекающийся музыкой и граффити, просыпается в странном месте, похожем на торговый район Сибуя в Токио. Не понимая, как он здесь оказался, Нэку обнаруживает у себя в руке необычный черный значок, да еще в придачу у него появлется способность читать мысли других людей.

Вдруг на его мобильный телефон приходит странное сообщение: «Достигни 104. У тебя есть шестьдесят минут. Ошибешься и лишишься лица. Жнецы». Нэку не может удалить сообщение, а таймер в шестьдесят минут отпечатывается на его правой руке. Он здесь, чтобы сыграть в «Игру жнецов», которая длится в общей сложности семь дней, а у всех игроков есть черный значок с черепом.

One day in the bustling city of Shibuya, a boy named Neku Sakuraba finds himself holding two black pins that enable him to read the minds of people around him. However, these pins also give him the ability to see the "Noise," hostile creatures capable of "erasing" people from existence. After discovering that he is trapped within the confines of the city, Neku receives a message regarding a mission that will nevertheless erase him should he fail.

While trying to fend off a Noise attack, Neku meets a girl named Shiki Misaki who asks him to form a partnership pact with her to fight against the monsters. Shiki explains that she and Neku have become "Players" participating in the "Reaper's Game"—an event spanning over seven days, each featuring a different mission.

As Neku and Shiki both strive to survive each day that passes, they begin to meet other Players and Reapers alike, battle stronger Noise, and learn the truth behind the mystery that this game is shrouded in.

[Written by MAL Rewrite]