Эта история вертится вокруг Йорито Моримии [森宮依人] — юного парня, посещающего среднюю школу. Он любит фотографировать небо, причём делает это в любое время дня и года. Однажды Йорито решает сфотографировать восход, которым начнётся новый день, но неожиданно его отвлекает девушка, пытающаяся принудить торговый автомат отдать ей то, за что она заплатила — банку томатного сока. Йорито помогает ей «починить» машину, одновременно пытаясь завязать с ней разговор — несмотря на то, что время уже четыре часа ночи. Йорито объясняет ей, почему он здесь в такую рань, но как раз в тот момент, когда ему удаётся вытащить банку из автомата, девушка загадочно исчезает…

Yorito Morimiya is obsessed with the sky. He especially loves taking pictures of its array of different faces—sunrises, sunsets, clouds. On one of his early-morning excursions to photograph the sunrise, Yorito meets a strange girl engaged in an argument with a vending machine. By the time that Yorito forces the girl's tomato juice out of the machine, she's vanished without a trace.

Sola follows the story of Yorito, his sister Aono, and their childhood friends Mana and Koyori Ishizuki, as well as that of a mysterious girl who appears and disappears, and who seems to harbor a dark secret. In a world where magic and the supernatural are never far below the surface and no one is who they seem to be, love and loneliness vie for supremacy beneath Yorito's sky.