Макото Ито [伊藤 誠] — обычный японский школьник, только-только начавший второй триместр в академии Сакакино. Во время ежедневных поездок в школу и обратно он влюбляется в девушку по имени Котоноха Кацура [桂 言葉]. Когда его одноклассница Сэкай Сайондзи [西園寺 世界] узнаёт о тайной любви Макото, то способствует знакомству этих двоих — так, что со временем парочка становится всё ближе и решается пойти на свидание. Несмотря на столь удачное и успешное «сватовство», осуществлённое ею, Сэкай ненароком начинает завидовать образовавшейся паре и ощущает невесть откуда взявшееся чувство к Макото.

На следующий вечер, в ожидании поезда у ближайшей станции напротив школы, Сайондзи встречает Ито, ждущего Кацуру, чтобы отправиться на свидание. Он садится рядом с ней и жарко благодарит за помощь, чувствуя себя в долгу и предлагая любую плату, какую он может дать. Сэкай думает, что он явно преувеличивает значимость сделанного, но, несмотря на это, решает получить своё вознаграждение, поцеловав его в тот момент, когда поезд, который она ждала, тронулся. Бросившись затем в открытую кабину, она оставляет поражённого и оплатившего свой долг Макото ожидать свидания.

High school student Makoto Itou first notices Kotonoha Katsura at the start of his second semester, freshman year. Immediately, he becomes entranced by her beauty, but his bashfulness doesn't allow him to approach her, even though they ride the same train every day. Instead, he snaps a photo of her in secret and sets it as his cell phone's wallpaper: a charm that, if kept under wraps, would supposedly help you realize your love. However, classmate Sekai Saionji spots the picture, but instead of ratting him out, she offers to help set him up with Kotonoha—going so far as befriending her just for him. Thus, the trio begins a rather impromptu friendship.

School Days follows the lives of these three teenagers as they traverse the joys and hardships that come with being a high schooler. In a story alive and brimming with romance and melancholy, the tale of these three students will linger in memory long after the momentous conclusion.

[Written by MAL Rewrite]