После того как родители четырнадцатилетней Тэцуко Арисугавы [Tetsuko Arisugawa] (она же Алиса) развелись, она была вынуждена вместе с матерью переехать из столицы в провинциальный городок и перевестись в другую среднюю школу. Соседи оказались очень таинственными личностями и пристально наблюдали за переездом из окна. Да и знакомство с новыми одноклассниками оказывается не таким, как она представляла: её сразу начинают игнорировать. Позже Алиса выясняет, что ей досталась парта ученика по имени Иуда, который, как говорят, был убит год назад, а таинственного наблюдателя, проживающего напротив, зовут Хана Араи [Hana Arai]. Однако всё это неспроста. Как загадочное убийство связано с девочкой Ханой, которая живёт по соседству, не ходит в школу и наблюдает за ней из окна?

Предыстория оригинального полнометражного фильма 2004 года «[[Хана]] и Алиса».

After transferring to Ishinomori Middle School, Tetsuko "Alice" Arisugawa overhears her classmates discussing a strange rumor. The previous occupant of her seat, a nondescript "Judas," is missing and presumed murdered—poisoned by one of his four wives. Amidst dealing with her mother's undesired meddling in her affairs and warding off her classmates' bullying, the troubled Alice starts to investigate the mystery surrounding Judas' disappearance.

The trail of clues leads her to the house of her next-door neighbor, the quirky and reclusive Hana Arai. After an awkward introduction, Hana agrees to help Alice and formulates a plan that may lead them to the answers they seek. The two girls embark on a journey to uncover what happened to Judas, and perhaps a friendship may start to blossom between the two along the way.

[Written by MAL Rewrite]