Альтернативное средневековье. В этом мире людям приходится сосуществовать с монстрами ёма, охотящимися на людей и пожирающими своих жертв. Для борьбы с ёма некая Организация создаёт орден воинов полулюдей, полуёма, и этот орден встаёт на защиту человечества, однако требует за это плату. Воинов ордена называют «Клеймор» по тому оружию, которым они владеют, но многие их зовут «серебряноглазыми ведьмами» из-за характерной внешности и безразличного отношения к другим. Каждая Клеймор имеет свой ранговый номер, дающийся в соответствии с силой и способностями.

История начинается с момента знакомства Клэр [クレア] — девушки, получеловека, полуёма, что пришла в небольшой городок выполнять одно из заданий Организации — и Лаки [ラキ], молодого человека, чьих родителей убил местный ёма. Эта встреча была отнюдь не случайна. Наших героев ждут нелегкие испытания, что прольют свет на все происходящее в этом мире и историю Клеймор, какой бы та легкой не казалась.

When a shapeshifting demon with a thirst for human flesh, known as "youma," arrives in Raki's village, a lone woman with silver eyes walks into town with only a sword upon her back. She is a "Claymore," a being manufactured as half-human and half-youma, for the express purpose of exterminating these monsters. After Raki's family is killed, the Claymore saves his life, but he is subsequently banished from his home. With nowhere else to go, Raki finds the Claymore, known as Clare, and decides to follow her on her journeys.

As the pair travel from town to town, defeating youma along the way, more about Clare's organization and her fellow warriors comes to light. With every town cleansed and every demon destroyed, they come closer to the youma on which Clare has sought vengeance ever since she chose to become a Claymore.

[Written by MAL Rewrite]