Второй сезон приоткроет перед нами завесу над жизнью одного из главных героев — Осаму Дадзая [太宰 治] — в период ещё до того, как он вступил в «Вооружённое детективное агентство», а также над причинами, которые подвигли его к этому поступку.

Кроме того, начало великого противостояния, заложенное в последней серии первого сезона, получит своё развитие. «Гильдия эсперов» под предводительством Фрэнсиса Фицджеральда [フランシス・スコット・キー・フィッツジェラルド] начнёт полномасштабную атаку не только на «Вооружённое агентство», но и на «Портовую мафию», не гнушаясь при этом самыми грязными методами, вплоть до уничтожения всего города.

Хрупкое равновесие криминального и законопослушного мира, существовавшее в Йокогаме, нарушено внезапным вторжением «Гильдии». Однако настоящий передел власти ещё впереди, ведь, как выясняется, есть много других тайных и не очень организаций, включающих в себя «одарённых», которые не прочь занять своё место под солнцем.

Новые враги и проблемы, новые друзья и союзники — сможет ли неуверенный в себе Ацуси Накадзима справиться со всем этим?

Despite their differences in position, three men—the youngest senior executive of the Port Mafia, Osamu Dazai; the lowest ranking member, Sakunosuke Oda; and the intelligence agent, Ango Sakaguchi—gather at the Lupin Bar at the end of the day to relax and take delight in the company of friends.

However, one night, Ango disappears. A photograph taken at the bar is all that is left of the three together.

Fast forward to the present, and Dazai is now a member of the Armed Detective Agency. The Guild, an American gifted organization, has entered the fray and is intent on taking the Agency's work permit. They must now divide their attention between the two groups, the Guild and the Port Mafia, who oppose their very existence.

[Written by MAL Rewrite]