В 1972 году экипаж «Аполлона-17» обнаружил на поверхности Луны так называемые Гиперврата, способные посредством телепортации проложить путь на Марс. В дополнение к Гипервратам, в ходе исследования планеты, землянам также посчастливилось открыть ещё одно наследие древней цивилизации — могучую технологию, позже названную «Альдноа». Сила этой технологии оказалась настолько велика, что первые люди, ступившие на поверхность Марса, едва заполучив её, возомнили себя избранниками богов. Выбрав путь космических ренегатов, вскоре они создали могущественную империю Верс, граждане которой стали называть себя новой высшей расой — марсианами. Землян же окрестили варварами и плебеями, недостойными силы «Альдноа», а потому подлежащими сокрушению во славу империи.

Спустя несколько десятилетий, нарастив военную мощь, молодая раса марсиан наконец решается объявить войну Земле. В ходе продолжительных боевых действий в 1999 году враждующие стороны умудряются уничтожить Гиперврата, а вместе с ними и Луну, осколки которой обрушиваются на Землю, унося миллионы жизней. Происшествие ставит точку в конфликте, устанавливается шаткое перемирие. Марсианская империя вынуждена переселиться на многочисленные орбитальные станции внутри пояса дрейфующих вокруг планеты осколков Луны.

Пятнадцать лет прошло с того дня, названного землянами «Крушение Небес». Принцесса империи Верс, внучка нынешнего императора, отправляется на Землю с миссией доброй воли. Полная надежд на лучшее мирное будущее для обеих рас, она вовсе не ожидает, что на неё уже готовится покушение, маленькой искрой разжигающее большое пламя новой войны.

The discovery of a hypergate on the Moon once allowed the human race to teleport to Mars. Those who chose to settle there unearthed a technology far more advanced than that of their home planet, which they named "Aldnoah." This discovery led to the founding of the Vers Empire of Mars and a declaration of war against the "Terrans," those who stayed behind on Earth. However, a battle on the moon—later called "Heaven's Fall"—caused the hypergate to explode, destroying the moon and leading the two planets to establish an uneasy ceasefire.

Their peace was a fragile one, however. Fifteen years later, high school student Inaho Kaizuka witnesses the plotted assassination of the Vers Empire's Princess Asseylum Vers Allusia, who had come to Earth in hopes of repairing the relationship between the empire and its homeland. The ceasefire is shattered, and the Martians declare war on the Terrans once again. In the face of this insurmountable enemy, Inaho and his friends must now fight against the Vers Empire to settle the war once and for all.

[Written by MAL Rewrite]